Viện Chấn thương - Chỉnh hình
Viện Tim mạch
Viện Lâm sàng các Bệnh truyền nhiễm
Viện Phẫu thuật Tiêu hoá
Viện điều trị Cán bộ cao cấp Quân đội
Viện Ung thư
Trung tâm Máy Gia tốc
Trung tâm Đột quỵ
Trung tâm nghiên cứu Y học Việt Đức
Trung tâm Xét nghiệm
Trung tâm Phẫu thuật sọ mặt và tạo hình
Trung tâm Đào tạo liên tục
Trung tâm Tư vấn di truyền và sàng lọc ung thư
Trung tâm Hỗ trợ sinh sản